Nat Biotechnol:研究无法重复?可能是HeLa细胞系“变”了

2021-11-03 06:00:21 来源:
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HeLa核糖体仍未在世界各地的许多分析中都心人才了近70年,并且依然被视为是无限供应的不变的相近核糖体。然而,2年底18日刊发在《Nature Biotechnology》月刊上的一项上新分析声称,核糖体在有所不同分析中都心捏综复杂普遍存在很大关联,这引发了对核糖体另有分析以此类推性的质疑。“我很欣慰看到这项分析,但在某种普遍性上我并不令人困惑,”杜克马修琪癌症中都心的免疫学Prasad Jallepalli说是,他并未策划这项分析。这并不是HeLa核糖体另有自诞生以来第一次注意到独特的报道:过往,其他分析调查小组也推论了HeLa核糖体反转锥体捏综复杂在基因序列和RNA暗示的许多现代关联。这项最近分析首次全面分析了各种HeLa反转锥体的遗传学反转(有所不同批次的HeLa核糖体另有生活习惯在世界各地的各个分析中都心),并且首次推论遗传学差异性导致了核糖体暗示和表观的变动。HeLa核糖体“变了”?在这项分析中都,分析工作人员从6个国内的13个分析中都心查阅了14份HeLa结果显示,并在相近的分析中都心前提下进行人才。他们首先计量了基因拷贝数反转,说明了了它们遗传物质捏综复杂的许多现代关联。结果发现,HeLa反转锥体捏综复杂,相当多是CCL2和Kyoto反转锥体捏综复杂普遍存在着相当大的差异性。进一步的分析声称,许多这些遗传学关联转化为mRNA产生的变动,并且在较小程度上转化为核糖体轻元素的变动。分析工作人员统计数据说是,HeLa CCL2和Kyoto核糖体另有的核糖体组和核糖体组谱彼此捏综复杂的关联,就像来自两种有所不同特性组织的癌核糖体另有捏综复杂的关联一样。HeLa反转锥体在人才处理过程中都土壤速度快也有所不同,一些核糖体为数众多并不需要17.5同一时间才能翻倍,而另一些核糖体在相近的人才前提下并不需要话费超过32同一时间。它们对破伤风接种的反应也有所有所不同:与其他两种变锥体相对于,一种变锥体对接种的敏感性较低,分析工作人员将其归因于低水平的核糖体核糖体,这种核糖体核糖体在细菌踏入消化道核糖体中都起作用。在一项单独的实验中都,分析调查小组通过人才核糖体另有三个年底,来注意到HeLa反转锥体的核糖体是否会随着间隔时间发生变动。分析工作人员记事了早期核糖体和中后期核糖体捏综复杂核糖体关联大约6%。日内瓦联邦理工学院分子另有统遗传学分析所的Ruedi Aebersell名誉教授是该分析的合着者,他说是,“即使在同一个分析中都心里,这些核糖体的关联和变动速度快也是非常惊人的。”他少于,如果一个研修在上新项目开始时用HeLa核糖体另有想到了一个实验,并在六个年底后被要求以此类推这个实验,他们可能会受益有所不同的结果。关于分析中都的“可复制性危机”的讨论大多数集中都在实验设计、数据分析上都的弱点,以及作为主要涡轮因素的均受废水或刷捏标签的核糖体另有。但是Aebersell视为,HeLa核糖体另有和癌核糖体另有的遗传学关联可能是最重要。为什么会“变”?柏克莱加州大学的核糖体遗传学家Tim Stearns视为有几个可能的原因可以表述为什么核糖体另有在长间隔时间人才下会发生变动。首先,HeLa核糖体是已知遗传物质无可避免癌核糖体,因此很可能随间隔时间随机突变。此外,它们还会在分析中都心中都均受到各种土壤前提的冲击,这可能会促成核糖体进化出上新独特的特征。例如,他说是,哺乳动物核糖体的人才有数将其人才到充满一个胶状为止,从胶状中都掺入一部分核糖体,然后将它们放在另一个胶状中都土壤,这一处理过程称为崩解。“每个人想到这件事的方式都有点有所不同,”他谈到。最近这些发现,对于人类人才核糖体的分析结果的表述和重现性有一定的普遍性。Aebersell和他的同事在分析成果中都明确提出上新了几个具锥体的上新技术。首先,分析工作人员不应使用癌核糖体另有的早期传代,并确保在同一核糖体另有的有所不同结果显示中都以此类推同一核糖体另有的实验。更重要的是,遗传学家不应确切地统计数据他们在给定的分析中都使用的核糖体另有反转锥体。
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